As duas formas – agencia e agência – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações.

Agencia, sem acentuação, é uma forma verbal do verbo agenciar, nomeadamente a terceira pessoa do singular do presente do indicativo e a segunda pessoa do singular do imperativo do verbo.

ele; ela; você [ agencia ], agencia [ tu ]

Ela agencia ou intervém nos negócios da empresa.
Um dos jogadores que ele agencia foi alvo de processo disciplinar.

Obs:
verbo agenciar = conseguir; granjear; tratar de negócios de outro; representar; negociar

Agência, com acento circunflexo na vogal “e”, é um substantivo que significa função ou escritório do agente; filial de estabelecimento; sucursal de firma comercial, banco; escritório onde se tratam negócios.

Funciona como uma agência de empregos.
Os responsáveis da agência de viagens são suspeitos de faturação fictícia.


Referências

Agencia advém do verbo agenciar.
Agência advém do latim agentia.