As duas formas – auferir e aferir – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas, devendo, no entanto, serem usadas em diferentes situações.

Auferir significa adquirir, colher, obter, receber ou oferecer vantagem.

Passei a auferir a remuneração que merecia.
O montante de pensão que vai auferir depende dos anos de descontos.

Aferir significa pôr a marca de aferição em; medir, avaliar; conferir cada aspecto com seu respectivo padrão.

São inquéritos para aferir a qualidade dos serviços.
Pretendemos aferir sobre o impacto desta iniciativa junto de nossos clientes.


Referências

Auferir advém do latim auferre.
Aferir advém do latim afferere.