As duas formas – fissão e fusão – existem na Língua Portuguesa.
Ou seja, ambas as expressões estão corretas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações, são palavras antônimas – o oposto de fissão é fusão.
Fissão é o ato de fender, de cindir = corte, separação ou cisão.
Interessa discutir se estamos perante um fissão da empresa.
O processo de fissão nuclear é a quebra do núcleo de um átomo instável em dois núcleos menores.
Fusão é o ato de fundir, de juntar = união, ajuntamento, aglomeração.
A fusão das empresas foi aprovada pelos acionistas.
Uma fusão ocorre quando dois ou mais elementos de um mesmo elemento se juntam.
Diz-se também da passagem de uma substância do estado sólido para o líquido.
Referências
Fissão advém do latim fissio.
Fusão advém do latim fusio.