As duas formas – cota e quota – existem na Gramática Portuguesa, ambas as expressões estão corretas, devendo, no entanto, serem usadas em conformidade com o contexto da frase.

Se for no sentido de quinhão, ou seja, da parte de um todo que cabe a cada um dos indivíduos pelo qual se divide, ambas as formas podem ser usadas. No entanto é dada preferência a quota.

Fazendo referência aos sinônimos de quota temos os seguintes termos: cota, cotização, cota-parte, parte, partilha, quantia , quinhão, quota, quotização, quota-parte.

Mas a palavra cota tem também outros significados:

  • Armadura de malha de ferro ou couro.
  • O lado oposto ao gume de uma ferramenta ou lâmina.
  • Antiga unidade de medida da Índia.
  • Distância entre um ponto do espaço e o plano horizontal de projeção.

Em resumo, usar quota ( ou cota ) quando o sentido é quinhão ou determinada porção e usar cota quando o sentido for num dos acima enunciados.