As duas formas – deposito e depósito – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações.

Deposito, não acentuado, é uma forma verbal do verbo depositar, nomeadamente a primeira pessoa do singular do presente do indicativo do verbo.

eu [ deposito ]

Liga-me assim que ele terminar, e eu deposito o próximo pagamento na sua conta.
Eu deposito toda a minha confiança no seu trabalho.

Depósito, acentuado, significa ato ou efeito de depositar; aquilo que foi depositado; lugar onde se deposita; tanque.

Dois trabalhadores ficaram feridos numa explosão registada num depósito de combustível.
Um depósito bancário é o ato de entrega de fundos de um depositante a um depositário.

Expressões:
depósito a prazo
depósito à vista
depósito bancário
depósito legal
depósito marinho


Referências

Deposito advém do verbo depositar.
Depósito advém do latim depositum.