A forma correta de escrita é embora de acordo com a Língua Portuguesa.
Ou seja, é escrito sem separação de termos de acordo com a norma; o termo “bora” é usado de forma informal como redução de “ir embora”.
Embora significa ainda que; posto que; para outro lugar e como ideia de partida, afastamento.
Eu vou embora. :: afastamento
Embora este não seja o método mais seguro, sempre é melhor que nada. :: ainda que
Em bora, ou melhor, “bora” (tal como referido) é usado de forma informal como redução de “ir embora”, “ir para outro lugar”, “ir fazer algo”, “vamos lá” etc.
Bora para onde?
Bora lá!
Bora fazer o manifesto?
Vam’bora que se faz tarde!
Referências
Embora advém de em boa hora.