A forma correta de escrita é estrutura de acordo com a Língua Portuguesa.
Ou seja, é escrito com a consoante “s” formando a sílaba es-.
Estrutura significa disposição das partes que formam um todo; partes de um corpo responsáveis pela sua resistência e/ou sustentação; o modo como partes organizadas se relacionam; o que é fundamental, essencial
São a estrutura básica do projeto.
Não sabemos se esta estrutura é estável.
A estrutura da sociedade ainda é desconhecida.
Palavras da mesma família também são escritas com “s”: estruturação, estruturante, estrutural, estruturalmente.
Extrutura não existe na Língua Portuguesa.
Referências
Advém do latim structura.