A forma correta de escrita é incorporar de acordo com a Língua Portuguesa; “encorporar” é a grafia antiga antiga, considerada atualmente incorrecto.

Ou seja, é escritp com a vogal “i” formando a sílaba in-.

Incorporar significa dar ou assumir forma de corpo; incluir, integrar; admitir em corporação; ingressar, passar a fazer parte de, integrar-se.

Correm rumores que ele vai incorporar a personagem de vilão.
A base de dados deve incorporar uma função que permita a importação de dados.

Encorporar não está correto na Língua Portuguesa. Como referido, é a grafia antiga e considerada atualmente incorrecto; alguns dicionários ainda registam este termo, assim como podemos encontrar em certos textos, mas é indicado ver: incorporar (forma correta).


Referências

Advém do latim incorporare.