As duas formas – munição e monição – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas, devendo, no entanto, serem usadas em diferentes situações.

Munição significa conjunto de cartuchos necessários ou disponíveis para uma arma; qualquer material bélico.

Foi um ataque terrorista devastador pois usaram munição de guerra.
Munição inteligente, guiada por laser, consegue atingir alvo a mais de 1,6 km de distância.

Monição significa um aviso judicial que o bispo faz antes de decretar a monitória.

A monição inicial, faz-se especialmente no Domingo de Ramos, em que preside o bispo.


Referências

Munição advém do latim munitio.
Monição advém do latim monitio.