A forma correta de escrita é sacudir de acordo com a Língua Portuguesa.

Ou seja, é escrito com a vogal “u” formando a sílaba -cu-

Sacudir significa agitar(-se) em vários sentidos, forte e sucessivamente; fazer tremer, estremecer(-se); pôr em movimento; abanar ou mover, ora para um, ora para outro lado.

Fechar o biberão e sacudir rapidamente para cima e para baixo.
Sacudir tapetes à janela é um hábito de muitos portugueses quando fazem a limpeza da casa.

Pode ter o sentido de causar abalo, comoção, estimular, incentivar.

Necessitamos de Homens capazes de sacudir esta sociedade.

Expressão:
sacudir a água do capote :: não assumir uma responsabilidade, livra-se de algo

Sacodir não está correto na Língua Portuguesa.


Referências

Advém do latim succutere.