A forma correta de escrita é seja de acordo com a Língua Portuguesa.
Ou seja, é escrito com a vogal “a” formando a sílaba -ja.
Seja é uma forma verbal do verbo ser, nomeadamente a primeira e terceira pessoa do singular do presente do subjuntivo do verbo.
que eu [ seja ], que ele; ela; você [ seja ]
Que ela seja feliz!
Dou o meu apoio ao relatório e espero que ele seja aprovado hoje.
Obs:
subjuntivo (português brasileiro) ou conjuntivo (português europeu) = modo verbal que não expressa certeza, e sim uma dúvida, desejo ou situações hipotéticas
Como conjunção exprime alternativa, significa ou, quer.
Seja hoje, seja amanhã, a verdade é que tens de estudar.
Como interjeição tem o sentido de consentimento.
Queres assim? Seja!
Seje não está correto Língua Portuguesa.
Referências
Advém do verbo ser.