As duas formas – auto e alto – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações.

Auto significa solenidade; ação pública; narração escrita e autenticada de qualquer ato; ato; ação; feito.

É uma das mais populares obras de Gil Vicente, o “Auto da Índia”.
Foram fiscalizadas 936 embarcações de pesca em todo o país, sendo que 471 autos de infração foram lavrados.

É também a abreviatura de automóvel.

A melhor opção de seguro auto, saúde e casa.

Alto significa de muita estatura; que tem altura; elevado, profundo; que está acima do observador; ilustrado, soberbo, importante; elevado ou intenso (o som).

O adolescente mais alto do mundo está prestes a entrar para a NBA.
Não creio que seja vantajoso falar mais alto.


Referências

São palavras parónimas: semelhantes tanto na escrita e na pronúncia mas com significado diferente.

Auto advém do latim actum.
Alto advém do latim altu.