As duas formas deixá-lo e deixa-lo estão corretas, contudo seus significados são diferentes.

Ou seja, ambas as palavras estão corretas e são formas verbais do verbo deixar com o pronome oblíquo átono “o” que assume a forma lo depois do verbo quando este termina em “r, s ou z” (ao mesmo tempo que a terminação verbal é suprimida) mas empregues em diferentes tempos verbais.

Deixá-lo, com acento agudo na vogal “a”, é referente ao infinitivo do verbo.

o deixar = [ deixá-lo ]

Não podemos deixá-lo sair do país.
Vamos deixá-lo dormir.
É melhor deixa-lo descansar esta tarde.
Vamos deixá-lo sozinho com os seus pensamentos, Eminência.

Obs:
infinitivo – transmite ideia de uma ação ou estado, porém sem vinculá-la a um tempo, modo ou pessoa específica

Deixa-lo, sem acento gráfico, é referente à segunda pessoa do singular do indicativo do verbo.

tu [ deixa-lo ]

É uma flexão menos usada mas válida.

Tu deixa-lo em paz.
Tu deixa-lo chorar, assim ele não fica dependente de ninguém.

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