As duas formas – emissão e imissão – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas, devendo, no entanto, serem usadas em diferentes situações.

Emissão significa o ato ou efeito de emitir; de expelir; conjunto de títulos; programa de televisão ou rádio

Ao queimar o combustível, emitimos CO2, o que influencia o efeito do aquecimento global.
A primeira emissão desta rádio foi em 1950.

Imissão significa o ato ou efeito de imitir(-se); de infiltrar-se, meter-se, introduzir-se, pôr-se.

Jurisprudência sobre imissão do arrematante na posse do imóvel.

obs: no direito a expressão “imissão de posse” é bastante usada, indicando o ato de adir, ou seja, tomar posse de bens ou herança

Se estivermos a no âmbito da poluição atmosférica:

processo de emissão = relativo à quantificação dos poluentes lançados na atmosfera
processo de imissão = relativo à quantificação dos que estão dispersos no ar


Referências

Emissão advém do latim emissĭo.
Imissão advém do latim immissìo.