As duas formas entendê-lo e entende-lo estão corretas, contudo seus significados são diferentes.

Ou seja, ambas as palavras estão corretas e são formas verbais do verbo entender com o pronome oblíquo átono “o” que assume a forma lo depois do verbo quando este termina em “r, s ou z” (ao mesmo tempo que a terminação verbal é suprimida) mas empregues em diferentes tempos verbais.

Entendê-lo, com acento circunflexo na vogal “e”, é referente ao infinitivo do verbo.

o entender = [ entendê-lo ]

Tentei entendê-lo, mas não consegui.
Para superar um obstáculo, precisas entendê-lo.
Meus filhos parecem entendê-lo muito melhor do que eu.

Obs:
infinitivo – transmite ideia de uma ação ou estado, porém sem vinculá-la a um tempo, modo ou pessoa específica
vogal e ou o – implica acento circunflexo

Entende-lo, sem acento gráfico, é referente à segunda pessoa do singular do indicativo do verbo.

tu o entendes = [ entende-lo ]

É uma flexão menos usada mas válida.

O gato é teu, tu entende-lo.
Eis o livro! Entende-lo e saberás tudo sobre a matéria.

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