As duas formas entendesse e entende-se existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas e são formas verbais do verbo entender mas empregues em diferentes pessoas gramaticais/tempos verbais; com distintas pronúncias.

Entendesse é a primeira e terceira pessoa do singular do pretérito imperfeito do modo subjuntivo do verbo.

se eu [ entendesse ], se ele; ela; você [ entendesse ]

Como se você entendesse a diferença!
Steve não seria amigo se não entendesse minha preocupação.
Realmente esperava que você também entendesse.

Obs:
subjuntivo (português brasileiro) ou conjuntivo (português europeu) = modo verbal que não expressa certeza, e sim uma dúvida, desejo ou situações hipotéticas

A forma entende-se, com hífen, é uma conjugação pronominal (acompanhado do pronome oblíquo “se”) do verbo – neste caso, no presente do indicativo. O pronome é usado para indicar ações relativas ao sujeito que as pratica, no caso ele, ela ou você.

Isso entende-se.
Por conseguinte, entende-se que não deve ser levantada a imunidade parlamentar de Marek.
Por «gases poluentes» entende-se o monóxido de carbono e os hidrocarbonetos.