As duas formas estágio e estagio estão corretas, contudo seus significados são diferentes.

Ou seja, ambas as palavras são válidas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações.

Estágio, com acento agudo na vogal “a”, é um substantivo – significa cada uma das etapas de um processo; situação transitória; permanência temporária numa empresa.

O último estágio da operação está para começar.
Eu consegui este estágio no Barclay’s Bank.

Estagio, sem acento gráfico, é a primeira pessoa do singular do presente indicativo do verbo estagiar.

eu [ estagio ]

Eu estagio em uma empresa de construção civil.


Referências

Estágio advém do latim stagium.
Estagio advém do verbo estagiar.