As duas formas – infecção e infeção – existem na Língua Portuguesa e têm o mesmo significado.

Infecção (ou infeção) significa o ato ou efeito de infeccionar; é a invasão de tecidos corporais de um organismo hospedeiro por parte de organismos capazes de provocar doenças.

Há uma infeção à volta dos ferimentos.
Não quero minimizar o risco de infecção.

Esta é uma das palavras em que um grande conjunto de falantes ainda pronuncia o “c” pelo que, e segundo o Acordo Ortográfico, admite-se a dupla grafia

Em Portugal a “tendência” tem sido a de escrever infeção (forma recomendada) por não se pronunciar o “c”.


Referências

Advém do latim infectione.