As duas formas – respeitaram e respeitarão – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas e são formas verbais do verbo respeitar, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes tempos gramaticais.

Respeitaram é a terceira pessoa do plural do pretérito perfeito do indicativo e a terceira pessoa do plural do pretérito mais-que-perfeito do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ respeitaram ]

« relativo a uma situação passada ou concluída »

Todos respeitaram o que dissestes.
As eleições na Tunísia respeitaram as normas democráticas?

Obs:
pretérito perfeito = referente ao passado
pretérito mais-que-perfeito = referente ao passado do passado

Respeitarão é a terceira pessoa do plural do futuro do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ respeitarão ]

« relativo a uma situação/possibilidade futura ou uma incerteza »

Eles respeitarão isso. Eventualmente.
Ou pões ordem ou jamais te respeitarão!