As duas formas – sequestraram e sequestrarão – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas e são formas verbais do verbo sequestrar, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes tempos gramaticais.

Sequestraram é a terceira pessoa do plural do pretérito perfeito do indicativo e a terceira pessoa do plural do pretérito mais-que-perfeito do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ sequestraram ]

« relativo a uma situação passada ou concluída »

São os mesmos rapazes que sequestraram o Wills.
Os rebeldes sequestraram aviões, e tomaram reféns.

Obs:
pretérito perfeito = referente ao passado
pretérito mais-que-perfeito = referente ao passado do passado

Sequestrarão é a terceira pessoa do plural do futuro do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ sequestrarão ]

« relativo a uma situação/possibilidade futura ou uma incerteza »

Ou lhes pagamos, ou sequestrarão nossos filho.
Será que eles sequestrarão o avião?