As duas formas soubesse e soube-se existem na Língua Portuguesa.
Ou seja, ambas as expressões estão corretas e são formas verbais do verbo saber mas empregues em diferentes pessoas gramaticais/tempos verbais; com distintas pronúncias.
Soubesse é a primeira e terceira pessoa do singular do pretérito imperfeito do modo subjuntivo do verbo.
se eu [ soubesse ], se ele; ela; você [ soubesse ]
Se eu soubesse teria trazido meus brinquedinhos.
Ele prometeu contactar-me se soubesse novidades.
Nunca morreria sem que você soubesse.
Obs:
subjuntivo (português brasileiro) ou conjuntivo (português europeu) = modo verbal que não expressa certeza, e sim uma dúvida, desejo ou situações hipotéticas
A forma soube-se, com hífen, é uma conjugação pronominal (acompanhado do pronome oblíquo “se”) do verbo – neste caso, no pretérito perfeito do indicativo. O pronome é usado para indicar ações relativas ao sujeito que as pratica, no caso ele, ela ou você.
Em outubro de 2007, soube-se que a investigação poderia ser arquivada.
Desde épocas antigas, soube-se que o vidro pode dobrar a luz.
Mais tarde soube-se que a informação sobre a família era falsa.