A forma correta de escrita é agitar de acordo com a Língua Portuguesa.

Ou seja, é escrito com a consoante “g” formando a sílaba -gi-

Agitar significa mover com frequência; abalar; comover; inquietar, alvoroçar.

O pó deve dissolver-se completamente sem agitar.
Precisava de agitar um pouco as coisas.

Ajitar não está correto na Língua Portuguesa.


Referências

Advém do latim agitare.