As duas formas – aguardaram e aguardarão – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas e são formas verbais do verbo aguardar, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes tempos gramaticais.

Aguardaram é a terceira pessoa do plural do pretérito perfeito do indicativo e a terceira pessoa do plural do pretérito mais-que-perfeito do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ aguardaram ]

« relativo a uma situação passada ou concluída »

As Nações Unidas aguardaram muito tempo até denunciarem a situação desse país.
Os russos cavaram trincheiras e aguardaram.

Obs:
pretérito perfeito = referente ao passado
pretérito mais-que-perfeito = referente ao passado do passado

Aguardarão é a terceira pessoa do plural do futuro do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ aguardarão ]

« relativo a uma situação/possibilidade futura ou uma incerteza »

As equipas aguardarão o teu sinal.
Atravessarão a floresta e aguardarão por vocês.