As duas formas alínea e alinha estão corretas, contudo seus significados são diferentes.
Ou seja, ambas as palavras são válidas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações.
Alínea significa nova linha escrita, cuja primeira palavra abre parágrafo; a primeira linha de um parágrafo; subdivisão de um artigo em uma lei.
A comissão sugere a eliminação desta alínea.
A última frase deveria constituir uma alínea separada.
Alinha é uma forma verbal do verbo alinhar, nomeadamente, a terceira pessoa do singular do presente do indicativo e a segunda pessoa do singular do imperativo do verbo.
ele; ela; você [ alinha ], [ alinha ] tu
A estátua não se alinha com nenhum daqueles edifícios.
Levou algumas horas, mas, ele alinha.
Referências
Alínea advém do latim a linea.
Alinha advém do verbo alinhar.