As duas formas comê-lo e come-lo estão corretas, contudo seus significados são diferentes.
Ou seja, ambas as palavras estão corretas e são formas verbais do verbo comer com o pronome oblíquo átono “o” que assume a forma lo depois do verbo quando este termina em “r, s ou z” (ao mesmo tempo que a terminação verbal é suprimida) mas empregues em diferentes tempos verbais.
Comê-lo, com acento circunflexo na vogal “e”, é referente ao infinitivo do verbo.
o comer = [ comê-lo ]
Talvez eu devesse comprar um daqueles cupcakes e comê-lo sozinho.
Ela não me ia deixar comê-lo.
Ele prefere guardar o bolo a comê-lo.
Não será desperdiçado, pois vai comê-lo mais tarde.
Obs:
infinitivo – transmite ideia de uma ação ou estado, porém sem vinculá-la a um tempo, modo ou pessoa específica
Come-lo, sem acento gráfico, é referente à segunda pessoa do singular do indicativo do verbo.
tu o comes = [ come-lo ]
É uma flexão menos usada mas válida.
Isso mesmo, come-lo!
O bolo? Sim.. tu come-lo que eu não quero.