As duas formas – destruíram e destruirão – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas e são formas verbais do verbo destruir, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes tempos gramaticais.

Destruíram é a terceira pessoa do plural do pretérito perfeito do indicativo e a terceira pessoa do plural do pretérito mais-que-perfeito do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ destruíram ]

« relativo a uma situação passada ou concluída »

Eles destruíram a minha magnífica criação.
Foi durante a guerra que destruíram a cultura, a arte, e tudo o que era frágil.

Obs:
pretérito perfeito = referente ao passado
pretérito mais-que-perfeito = referente ao passado do passado

Destruirão é a terceira pessoa do plural do futuro do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ destruirão ]

« relativo a uma situação/possibilidade futura ou uma incerteza »

Se lutarmos, ele nos destruirão.
Ou seja, destruirão a sua credibilidade se ele não cumprir as ordens.