As duas formas difere e defere estão corretas, contudo seus significados são diferentes.

Ou seja, ambas as palavras são válidas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações; são relativas a verbos diferentes.

Difere é a terceira pessoa do singular do presente do indicativo e a segunda pessoa do singular do imperativo do verbo diferir.

ele; ela; você [ difere ], [ difere ] tu

Ele difere a decisão até nova análise do caso.
Essa realidade não difere das demais.

Obs:
verbo diferir (trans.) = adiar; deixar para ocasião futura
verbo diferir (trans. e intrans.) = divergir de; ser diferente; diferenciar

Defere é a terceira pessoa do singular do presente do indicativo e a segunda pessoa do singular do imperativo do verbo deferir.

ele; ela; você [ defere ], [ defere ] tu

Não sei porque o tribunal não defere o meu pedido.
No seu parecer ela defere a recuperação judicial da empresa.

Obs:
verbo deferir = atender; conceder; despachar favoravelmente

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