As duas formas – frequentaram e frequentarão – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas e são formas verbais do verbo frequentar, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes pessoas/tempos gramaticais.

Frequentaram é uma forma verbal do verbo frequentar, nomeadamente a terceira pessoa do plural do pretérito perfeito do indicativo e a terceira pessoa do plural do pretérito mais-que-perfeito do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ frequentaram ]

{ relativo a uma situação passada ou concluída }

Todos eles frequentaram um curso nos Estados Unidos.
Vocês frequentaram a minha igreja.

Obs:
pretérito perfeito = referente ao passado
pretérito mais-que-perfeito = referente ao passado do passado

Frequentarão é uma forma verbal do verbo frequentar, nomeadamente a terceira pessoa do plural do futuro do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ frequentarão ]

{ relativo a uma situação/possibilidade futura ou uma incerteza }

Todos eles frequentarão 10 atividades no próximo ano.
Muitos de vocês frequentarão palestras, irão a retiros e farão peregrinações.