As duas formas há exceção e à exceção estão corretas, contudo seus significados são diferentes.

Ou seja, ambas as construções são válidas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações.

Há exceção é equivalente a dizer que existe semelhança (verbo haver no sentido de existência) – toma habitualmente o sentido de que existe algo não correspondente a uma regra; que não confirma uma regra ou generalização.

Como em toda regra, há exceção.
Não há exceção a esta regra, vem sempre a verdade!
Há exceção apenas em relação às carnes que já são industrializadas e possuem certificação.

A construção à exceção é utilizada quando fazemos menção a + «a exceção»; quando tal acontece somos a escrever com a crase à = a + a. Toma habitualmente o sentido de exclusão, salvo, fora ou exceto. Notar que exceção é um substantivo feminino.

À exceção dele, tem sido uma noite calma.
Nada mudou na minha vida, à exceção disto.
Se recusam a falar qualquer coisa à exceção de sua própria língua…