As duas formas imerso e emerso estão corretas, contudo seus significados são diferentes.
Ou seja, ambas as palavras são válidas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações; são geralmente opostos, antônimos.
Imerso significa que (se) imergiu; mergulhado, afundado, submerso.
O carro está imerso em água.
Ele foi imerso em água, por isso não poderemos testar pelos resíduos de pólvora.
Tem estado imerso em luto nos últimos dez anos.
Emerso significa que (se) emergiu; que saiu de debaixo da água ou donde estava mergulhado; surgido, aparecido, elevado.
A verdade tinha emerso.
O barco que naufragou foi emerso pela marinha.
Referências
Imerso advém do latim immersus.
Emerso advém do latim emersu.