As duas formas perguntaste e perguntas-te existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas e são formas verbais do verbo perguntar mas empregues em diferentes modos e com distintas pronúncias.

Perguntaste é a segunda pessoa do singular do pretérito perfeito do modo indicativo do verbo.

tu [ perguntaste ]

Direi ao Pieter que perguntaste por ele.
Esta é realmente a história toda, já que perguntaste.
Nem perguntaste se eu estava bem.

Obs:
pretérito perfeito = referente ao passado
verbo perguntar = fazer uma pergunta a alguém; inquirir, interrogar; tentar saber, indagar

A forma perguntas-te é uma conjugação pronominal (acompanhado do pronome oblíquo “te”) do verbo – neste caso, no presente do indicativo. O pronome é usado para indicar ações relativas ao sujeito que as pratica ( tu ).

É uma flexão pouco utilizada – significa que perguntas para ti próprio ou de ti próprio.

Esperas e esperas, e depois perguntas-te porque perdeste.
Às vezes perguntas-te como é que acabaste nisto, certo?