As duas formas preenchê-lo e preenche-lo estão corretas, contudo seus significados são diferentes.

Ou seja, ambas as palavras estão corretas e são formas verbais do verbo preencher com o pronome oblíquo átono “o” que assume a forma lo depois do verbo quando este termina em “r, s ou z” (ao mesmo tempo que a terminação verbal é suprimida) mas empregues em diferentes tempos verbais.

Preenchê-lo, com acento circunflexo na vogal “e”, é referente ao infinitivo do verbo.

o preencher = [ preenchê-lo ]

Basta preenchê-lo e nós entraremos em contato.
Um vácuo foi criado, e alguém deve preenchê-lo.
Você pode tirar uma foto de um formulário impresso e preenchê-lo no seu tablet.

Obs:
infinitivo – transmite ideia de uma ação ou estado, porém sem vinculá-la a um tempo, modo ou pessoa específica

Preenche-lo, sem acento gráfico, é referente à segunda pessoa do singular do indicativo do verbo.

tu o preenches = [ preenche-lo ]

É uma flexão menos usada mas válida.

Eis o impresso; preenche-lo com cuidado.
Constrói um conjunto de dados e preenche-lo com algarismos.

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