As duas formas – referência e referencia – existem na Língua Portuguesa.
Ou seja, ambas as expressões estão corretas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações.
Referência, com acento circunflexo, é um substantivo – significa ato ou efeito de referir; relação de umas coisas com as outras; alusão; aquilo que é referido, relatado.
Vamos utilizar estes dados como referência.
Nunca ninguém me viu como referência moral.
Referencia, não acentuado, é a terceira pessoa do singular do presente do indicativo e a segunda pessoa do imperativo de verbo referenciar.
ele; ela; você [ referencia ], [ referencia ] tu
A certa altura, durante o discurso, ela referencia o antigo professor.
Ele referencia esse facto em várias das suas obras.
Referências
Referência advém do latim referentia.
Referencia advém do verbo referenciar.