As duas formas – retificar e ratificar – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes situações.

Retificar significa corrigir endireitar; alinhar.

Entregue novamente o ficheiro para retificar a situação.
Foi o Tribunal que me pediu para retificar porque um campo da declaração não estava correto.

Obs:
Anterior ao AO 1990: rectificar

Ratificar significa confirmar, reafirmar, validar, autenticar, revalidar, corroborar, comprovar.

Fez bem o Conselho de Ministros ao ratificar o acordo.
As autoridades nacionais têm de decidir de que forma irão ratificar o Tratado.


Referências

São palavras parónimas: semelhantes tanto na escrita e na pronúncia mas com significado diferente.

Retificar advém do latim rectificare.
Ratificar advém do infinito latim ratificare.