As duas formas – conheceram e conhecerão – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas e são formas verbais do verbo conhecer, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes tempos gramaticais.

Conheceram é a terceira pessoa do plural do pretérito perfeito do indicativo e a terceira pessoa do plural do pretérito mais-que-perfeito do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ conheceram ]

« relativo a uma situação passada ou concluída »

Eles se conheceram em abril passado.
Conheceram-no pela pior razão, era um vigarista!
Sabe como é que os seus pais se conheceram?

Obs:
pretérito perfeito = referente ao passado
pretérito mais-que-perfeito = referente ao passado do passado

Conhecerão é a terceira pessoa do plural do futuro do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ conhecerão ]

« relativo a uma situação/possibilidade futura ou uma incerteza »

Um dia, conhecerão o sabor da vitória!
Alunos reprovados conhecerão alternativas só na segunda-feira.