A forma correta de escrita é desconto de acordo com a Língua Portuguesa.
Ou seja, é escrito com a vogal “e” formando a sílaba des-.
Desconto significa ato ou efeito de descontar; dedução de uma quantia a receber; compensação.
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É também uma forma verbal do verbo descontar, nomeadamente a primeira pessoa do singular do presente do indicativo do verbo.
eu [ desconto ]
Eu desconto todos os meses no meu salário.
Disconto não existe na Língua Portuguesa.
Referências
Advém do verbo descontar.