As duas formas – encheram e encherão – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas e são formas verbais do verbo encher, devendo, no entanto, ser usadas em diferentes tempos gramaticais.

Encheram é a terceira pessoa do plural do pretérito perfeito do indicativo e a terceira pessoa do plural do pretérito mais-que-perfeito do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ encheram ]

« relativo a uma situação passada ou concluída »

Ontem, eles limparam e encheram a piscina.
Milhares de pessoas encheram o pavilhão para ouvir umas palavras de esperança.

Obs:
pretérito perfeito = referente ao passado
pretérito mais-que-perfeito = referente ao passado do passado

Encherão é a terceira pessoa do plural do futuro do indicativo do verbo.

eles; elas; vocês [ encherão ]

« relativo a uma situação/possibilidade futura ou uma incerteza »

Eles te encherão de prêmios, mas nunca te contratarão.
E as eiras se encherão de trigo, e os lagares trasbordarão de mosto e de azeite.