A forma correta de escrita é incomodo de acordo com a Língua Portuguesa.
Ou seja, é escrito com a vogal “i” formando a sílaba in-.
Incomodo é uma forma verbal do verbo incomodar, nomeadamente a primeira pessoa do singular do presente do indicativo do verbo.
eu [ incomodo ]
Incomodo alguém se aumentar o volume do som?
É bom saber que eu incomodo, vou embora!
Notar que incómodo / incômodo, acentuados na vogal “o”, significam sem comodidade; que incomoda; enfadonho.
A acne é um incómodo.
Peço desculpa pelo incómodo causado.
Os termos encomodo ou em comodo não exsitem na Língua Portuguesa.
Referências
Advém do verbo incomodar.