As duas formas – percentagem e porcentagem – existem na Língua Portuguesa.

Ou seja, ambas as expressões estão corretas e tem o mesmo significado; a única diferença é o País onde é usado (de certo modo, digamos).

Percentagem ou porcentagem significa fração centesimal de uma grandeza; proporção em relação a cem; quantia paga ou recebida na razão de uns tanto por cento; comissão.

A percentagem da população envolvida na agricultura é de 15%.
Cobram porcentagem elevada?

Em Portugal a forma mais comum é “percentagem” e raramente se usa a forma “porcentagem”.

No Brasil a forma mais comum é “porcentagem” e não se trata de um “brasileirismo”; é um vocábulo dicionarizado.

O mesmo, em termos de País (região), acontece com os vocábulos percentual e porcentual; ambos perfeitamente corretos, com o mesmo significado.


Referências

Percentagem advém do inglês percentage.
Porcentagem advém da construção por + cento.